近江国日吉神社を勧進し、山王権現と称していたが、明治になり日吉神社となった。18世紀に書かれた「丹波志」に記載されており、江戸時代に祭りが斎行されていたことが分かる。

秋季例大祭では、宮司の祝詞のあとに子供神輿や獅子舞が巡行する。